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2001年，李家洋当选为中国科学院院士。
2004年，李家洋当选发展中国家科学院院士。
2004年-2011年间，李家洋担任中国科学院副院长、党组成员。
2009年2月23日至27日，李家洋以中科院副院长的身份，率院士代表团到香港中文大学讲学访问。
2011年-2016年12月，李家洋担任农业部党组成员、副部长，中国农业科学院院长。
2011年5月，李家洋当选为美国国家科学院外籍院士。
2012年，李家洋当选为德国科学院院士。
2013年5月，李家洋入选欧洲分子生物学组织外籍成员。
2015年5月4日，李家洋当选英国皇家学会外籍会员。
2019年11月16日，李家洋当选国际欧亚科学院（中国）副主席。
