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1994年，贺福初博士毕业后，留在军事医学科学院放射医学研究所
工作，先后担任军事医学科学院实习研究员、助理研究员、副研究员、研究员、副所长、所长，副院长，院长。
1996年，贺福初获得国家杰出青年科学基金资助。
2001年，年仅39岁贺福初成功当选为中国科学院院士。
2002年，贺福初院士被中央军委授予专业技术少将军衔。
同年，人类蛋白质组研究组织（Human Proteome Organization）启动，贺福初院士担任人类肝脏蛋白质组计划（HLPP）负责人，成为中国领导此类大型国际研究计划的第一人。
2003年10月，贺福初院士担任人类肝脏蛋白质组计划主席，并开始牵头组建北京（国家）蛋白质组研究中心。
2004年，贺福初院士创立了复旦大学生物医学研究院。
2005年，贺福初院士当选发展中国家科学院院士。
2009年，贺福初院士担任中国人民解放军军事医学科学院院长。
