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2002年起，陈晔光担任清华大学生命科学学院教授、博士生导师。
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2004年起，陈晔光担任清华大学生物科学与技术系教授、副系主任。
2006年起，陈晔光担任生物膜与膜生物工程国家重点实验室主任。
2007年，陈晔光入选“新世纪百千万人才工程”。
2009年起，陈晔光担任清华大学生命科学学院教授、副院长。
2017年，陈晔光当选为中国科学院院士。
2018年起，陈晔光担任广州再生医学与健康广东省实验室马普组织干细胞与再生医学研究中心主任。
2022年起，陈晔光担任南昌大学教授、常务副校长。
2022年11月，陈晔光担任南昌大学校长。